• Análisis Conceptual.
• Metodología de la Investigación Jurídica.
• Teoría del Derecho.

El Dr. Agüero está adscrito a las siguientes líneas de investigación del Doctorado en Derecho, mención en Constitucionalismo y Derecho:

• Activismo Judicial y Estado Constitucional;
• Teoría de las Normas y del Razonamiento Jurídico.

Actualmente es profesor tutor de la tesis doctoral de

• Camila Matamala V.

Está interesado en supervisar proyectos relacionados con:

• Teoría del derecho: teoría de las normas y teoría de los sistemas jurídicos
• Metodología de la investigación jurídica: análisis del conceptual
• Mecanismos de cambio normativo: tipos, alcances y efectos

• 2017 - 2019, Ministerio de Economía y Competitividad (España). ''Justicia Global: Implicaciones Institucionales». Institución: Universitat Pompeu Fabra (Barcelona-España). Investigador principal: Josep Joan Moreso. (DER2016-80471-C2-2-R)''. Investigador. 2 años.
• 2016 - 2018, FONDECYT INICIACIÓN 11160737. ''Seguridad jurídica a través del estudio de las antinomias: Una propuesta de explicitación de los criterios y conceptos empleados por la jurisprudencia nacional''. Investigador Responsable. 2 años.
• 2014 - 2016, Ministerio de Economía y Competitividad (España). ''Constitucionalismo Global y Justicia Global: Fundamentos Filosóficos. (DER2013-48066-C21R)''. Investigador. 2 años.
• 2014 - 2016, Agènci de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (Cataluña). ''Grup de Consolidat de Filosofia del Dret. (SGR 2014-626)''. Investigador. 2 años.
• 2011 - 2017, Ministerio de Educación y Ciencia (España). ''Objetividad en el Derecho y en la legitimidad política. (DER2010-21331-C02-01)''. Investigador. 6 años.
• 2011 - 2014, Entidad financiadora Ministerio de Ciencia y Educación Superior (España). ''Objectivity in Legal Discourse. The Comparative Perspective''. Investigador. 3 años.

• 2017. Sebastián Agüero San Juan. La contravención como amaño. Un análisis de la sentencia CAS2014/A/3628 del Tribunal de Arbitraje Deportivo. Fair play. Journal of philosophy, ethics and sports law. 9: 1-30. Autor.
• 2016. Sebastián Agüero San Juan. Seguridad jurídica a través del análisis de los mecanismos de exclusión normativa. Una presentación del caso español. Diritto & Questioni Pubbliche. Università degli Studi di Palermo. 16 Autor.
• 2016. Sebastián Agüero San Juan. Josep María Vilajosana Rubio, Las razones de la pena, Tirant lo Blanch, Valencia, 2015 (183 pp). Revista de Derecho (Valdivia) (Scopus). 30. Autor.
• 2015. Sebastián Agüero San Juan. Sobre el concepto de hacer trampa en el deporte organizado. Un inventario temático de problemas. Fair play. Journal of philosophy, ethics and sports law. 3: 154- 181. Autor.
• 2015. Sebastián Agüero San Juan. Las antinomias y sus condiciones de surgimiento. Una propuesta para los enunciados jurídicos. Revista de Derecho (Valdivia) (Scopus). 28: 31-46. Autor.
• 2011. Sebastián Agüero San Juan. Malem, J; Ezquiaga, J; Andrés, P. (2009). El error judicial. La formación de los jueces. Madrid: Fundación Coloquio Jurídico Europeo, 157 pp. Revista de Educación y Derecho. 4. Autor.
• 2010. Sebastián Agüero San Juan. Apuntes sobre las dificultades en la determinación del estatus científico de la Criminología. Revista Chilena de Derecho y Ciencia Política. (LATINDEX). 1 49. Autor.